Modelos que aprenden el lenguaje de las moléculas

Modelos que aprenden el lenguaje de las moléculas y cómo utilizarlos para predecir sus propiedades.

Raúl Fernández Díaz

19 y 20 de marzo de 2024

Actividad Formativa multirrama para Salud, Ciencias e Ingenierías

Este curso-taller se imparte de forma remota por videoconferencia en la plataforma de la Universidad de Alcalá. El enlace a la sesión, igual para los tres días del taller, se publicará aquí tras terminar la inscripción:

Enlace próximamente

Por favor, utilice su nombre y apellidos para identificarse en la sesión de cara a poder realizar el seguimiento de asistencia y la certificación posterior.

Formulario de inscripción

El Curso de «Modelos que aprenden el lenguaje de las moléculas» está organizado por el Programa de Doctorado en Señalización Celular. Está integrado en el IX Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2024, y constituye una Actividad Formativa multirrama de la Escuela de Doctorado de la Universidad de Alcalá, ofertado para las ramas de Salud, Ciencias e Ingenierías.

El Curso consta de tres sesiones, dos de una hora de exposición seguida de debate cada una y una tercera de actividad práctica guiada. Para el reconocimiento del curso como actividad formativa de doctorado será necesario, por normativa de la UAH, rellenar un formulario de seguimiento posterior a cada sesión. El enlace se publica en el transcurso de la sesión.

Resumen

Las técnicas de aprendizaje profundo (deep learning) están adquiriendo creciente importancia en todos los campos de la ciencia, pero tienen un enorme potencial especialmente en biomedicina para facilitar el diagnóstico de enfermedades o acelerar el descubrimiento de medicamentos. En este taller se realizará una exposición de qué son las redes neurales, cómo funcionan y qué aplicaciones tienen. Explicaremos lo que son los modelos de lenguaje y cómo se pueden utilizar para predecir propiedades de moléculas (proteínas, ácidos nucleicos y fármacos) y recorreremos diferentes técnicas para evaluar los modelos generados. El curso contará con un caso práctico en el que los asistentes podrán re-entrenar un modelo de lenguaje para predecir la toxicidad de moléculas pequeñas y comparar diferentes métodos de evaluación.
IMPORTANTE.- Este curso no se imparte a través del Campus Online-Aula Virtual. Toda la información y accesos se encuentran en esta página.

Materiales requeridos

  • Cuenta de Google Drive.
  • Dos archivos que se proveerán por correo electrónico tras la inscripción en el taller. También puede descargar aquí el archivo comprimido en zip: Enlace próximamente

Calendario y objetivos de aprendizaje

Sesión 01 – Fundamentos de aprendizaje profundo

19/03/2024 (11:15 – 12:15)

Sesión 02 – Aplicación de arquitecturas avanzadas en biomedicina

19/03/2024 (15:00 – 16:15)

Sesión 03 – Sesión práctica guiada.

16/03/2022 (15:00 – 16:30)

Re-entrenamiento de un modelo de lenguaje para predecir la toxicidad de moléculas pequeñas y comparar diferentes métodos de evaluación.

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