Materiales requeridos

• Fiji (ImageJ). Descargar e instalar programa.
  https://imagej.net/software/fiji/
• Imagen de prueba:
  imagen_prueba.zip
• Otros documentos y enlaces enviados por email a todos los participantes inscritos. Si no lo ha recibido, por favor, escriba al organizador del curso.

Introducción a la Mecanobiología: conversaciones entre física y biología.

Fidel Lolo Romero
Grupo de mecanoadaptación y biología caveolar
Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares, CNIC

21 de marzo de 2024

Actividad Formativa multirrama para Salud, Ciencias e Ingenierías

El curso de “Introducción a la Mecanobiología: conversaciones entre física y biología” se realizará de forma presencial en el Edificio de Medicina y Ciencias de la Salud (aula por determinar) con retransmisión simultánea por videoconferencia usando la plataforma de la Universidad de Alcalá. El enlace a la sesión es el siguiente:

Enlace

https://is.gd/remoto2024

21 de marzo, sesiones de mañana y tarde

Por favor, utilice su nombre y apellidos para identificarse en la sesión de cara a poder realizar el seguimiento de asistencia y la certificación posterior.

Formulario de inscripción

El Curso de «Introducción a la Mecanobiología: conversaciones entre física y biología.» está organizado por el Programa de Doctorado en Señalización Celular. Está integrado en el IX Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2024, y constituye una Actividad Formativa multirrama de la Escuela de Doctorado de la Universidad de Alcalá, ofertado para las ramas de Salud, Ciencias e Ingenierías.

El Curso consta de cinco horas totales distribuidas en tres sesiones según se detalla más abajo, en el apartado de Calendario y objetivos de aprendizaje. Para el reconocimiento del curso como actividad formativa de doctorado será necesario, por normativa de la UAH, rellenar un formulario de seguimiento posterior a cada sesión.

Resumen

¿Puede un biólogo entenderse con un físico? Este curso-taller revisa distintas tecnologías que nos permiten ahondar en los misterios de la mecanobiología celular, la capacidad de las células para percibir y transducir estímulos mecánicos. El curso se divide en tres sesiones: una primera sesión de “introducción a la mecanobiología”, de una hora de exposición seguida de debate, y dos sesiones teórico-prácticas de dos horas cada una, dedicadas a “mecanobiología vascular” y “mecanobiología del sistema nervioso”. Cada una de estas dos sesiones incluye una hora de exposición seguida de una hora de actividad práctica guiada, con información y materiales experimentales reales, aplicando estrategias computacionales de extracción y análisis de datos.

Materiales requeridos

• Fiji (ImageJ). Descargar e instalar programa.
  https://imagej.net/software/fiji/
• Imagen de prueba:
  imagen_prueba.zip
• Otros documentos y enlaces enviados por email a todos los participantes inscritos. Si no lo ha recibido, por favor, escriba al organizador del curso.

Calendario y objetivos de aprendizaje

Sesión 01 – Introducción a la mecanobiología

21/03/2024 (11:15 – 12:15)

Sesión 02 – Aproximación a la mecanobiología vascular.

21/03/2024 (15:00 – 16:15)

• Mecanobiología como base de la patología vascular.
• Actividad práctica guiada. Se utilizarán resultados y materiales experimentales reales suministrados y aplicación de estrategias computacionales de extracción y análisis de datos.

Sesión 03 – Aproximación a la mecanobiología del sistema nervioso

21/03/2024 (16:30 – 18:00)

• Mecanobiología como base de la neuropatología:
  potenciales implicaciones.
• Actividad práctica guiada. Se utilizarán resultados y materiales experimentales reales suministrados y aplicación de estrategias computacionales de extracción y análisis de datos.

 

Modelos que aprenden el lenguaje de las moléculas y cómo utilizarlos para predecir sus propiedades.

Raúl Fernández Díaz

19 y 20 de marzo de 2024

Actividad Formativa multirrama para Salud, Ciencias e Ingenierías

Este curso-taller se imparte de forma remota por videoconferencia en la plataforma de la Universidad de Alcalá. El enlace a la sesión, igual para los tres días del taller, se publicará aquí tras terminar la inscripción:

Enlace próximamente

Por favor, utilice su nombre y apellidos para identificarse en la sesión de cara a poder realizar el seguimiento de asistencia y la certificación posterior.

Formulario de inscripción

El Curso de «Modelos que aprenden el lenguaje de las moléculas» está organizado por el Programa de Doctorado en Señalización Celular. Está integrado en el IX Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2024, y constituye una Actividad Formativa multirrama de la Escuela de Doctorado de la Universidad de Alcalá, ofertado para las ramas de Salud, Ciencias e Ingenierías.

El Curso consta de tres sesiones, dos de una hora de exposición seguida de debate cada una y una tercera de actividad práctica guiada. Para el reconocimiento del curso como actividad formativa de doctorado será necesario, por normativa de la UAH, rellenar un formulario de seguimiento posterior a cada sesión. El enlace se publica en el transcurso de la sesión.

Resumen

Las técnicas de aprendizaje profundo (deep learning) están adquiriendo creciente importancia en todos los campos de la ciencia, pero tienen un enorme potencial especialmente en biomedicina para facilitar el diagnóstico de enfermedades o acelerar el descubrimiento de medicamentos. En este taller se realizará una exposición de qué son las redes neurales, cómo funcionan y qué aplicaciones tienen. Explicaremos lo que son los modelos de lenguaje y cómo se pueden utilizar para predecir propiedades de moléculas (proteínas, ácidos nucleicos y fármacos) y recorreremos diferentes técnicas para evaluar los modelos generados. El curso contará con un caso práctico en el que los asistentes podrán re-entrenar un modelo de lenguaje para predecir la toxicidad de moléculas pequeñas y comparar diferentes métodos de evaluación.
IMPORTANTE.- Este curso no se imparte a través del Campus Online-Aula Virtual. Toda la información y accesos se encuentran en esta página.

Materiales requeridos

• Cuenta de Google Drive.
• Dos archivos que se proveerán por correo electrónico tras la inscripción en el taller. También puede descargar aquí el archivo comprimido en zip: Enlace próximamente

Calendario y objetivos de aprendizaje

Sesión 01 – Fundamentos de aprendizaje profundo

19/03/2024 (11:15 – 12:15)

Sesión 02 – Aplicación de arquitecturas avanzadas en biomedicina

19/03/2024 (15:00 – 16:15)

Sesión 03 – Sesión práctica guiada.

16/03/2022 (15:00 – 16:30)

Re-entrenamiento de un modelo de lenguaje para predecir la toxicidad de moléculas pequeñas y comparar diferentes métodos de evaluación.

Un laboratorio verde.
Recorrido molecular, farmacognóstico y etnobotánico por el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá.

Ignacio Moratilla-Rivera

20 de marzo de 2024

Actividad Formativa multirrama para Salud y Ciencias

El curso “Un laboratorio verde. Recorrido molecular, farmacognóstico y etnobotánico por el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá.” se realizará de forma presencial en el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá.

Formulario de inscripción

El Curso «Un laboratorio verde. Recorrido molecular, farmacognóstico y etnobotánico por el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá.» está organizado por el Programa de Doctorado en Señalización Celular. Está integrado en el IX Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2024, y constituye una Actividad Formativa multirrama de la Escuela de Doctorado de la Universidad de Alcalá, ofertado para las ramas de Salud y Ciencias.

El Curso consiste en un recorrido guiado y comentado de 1 hora y media de duración, por el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá. Para el reconocimiento del curso como actividad formativa de doctorado será necesario, por normativa de la UAH, rellenar un formulario de seguimiento posterior.

Resumen

Las plantas son organismos fotoautótrofos, es decir, emplean la energía de la luz solar para sintetizar sus propias biomoléculas. Aparte de las moléculas que componen su estructura y que proporcionan energía, existen los conocidos como metabolitos secundarios. Son productos provenientes de diferentes vías metabólicas y que tienen funciones ecológicas importantes. Los seres humanos a lo largo de nuestra historia hemos sabido sacar provecho de estas sustancias al emplearlas con fines terapéuticos. Ejemplos son la morfina procedente de la adormidera blanca, los alcaloides de la vinca, la capsaicina de los pimientos y muchos otros. En la actualidad forman parte de nuestro arsenal farmacológico, pero existen todavía una inmensa cantidad de especies sin estudiar, por lo que nunca se sabe cuál podrá ser el siguiente fitoquímico revolucionario. En un recorrido por el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá, se pueden apreciar las características morfológicas, ecológicas, evolutivas, farmacológicas y moleculares de las plantas que ahí se encuentran. El Jardín cuenta con gran cantidad de plantas, tanto autóctonas, de diversos ecosistemas de nuestro país, como de otros lugares del mundo, algunas en invernadero. Además, podemos encontrar una huerta ecológica con plantas de interés medicinal y nutricional. Este recorrido permite transmitir a los visitantes una visión completa de lo interesante y útiles que son las plantas.

Un laboratorio verde. Recorrido molecular, farmacognóstico y etnobotánico por el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá.

Ignacio Moratilla-Rivera

20 de marzo de 2024

Actividad Formativa multirrama para Salud y Ciencias

El curso “Un laboratorio verde. Recorrido molecular, farmacognóstico y etnobotánico por el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá.” se realizará de forma presencial en el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá.

Formulario de inscripción

El Curso «Un laboratorio verde. Recorrido molecular, farmacognóstico y etnobotánico por el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá.» está organizado por el Programa de Doctorado en Señalización Celular. Está integrado en el VIII Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2023, y constituye una Actividad Formativa multirrama de la Escuela de Doctorado de la Universidad de Alcalá, ofertado para las ramas de Salud y Ciencias.

El Curso consiste en un recorrido guiado y comentado de 2 horas de duración, por el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá. Para el reconocimiento del curso como actividad formativa de doctorado será necesario, por normativa de la UAH, rellenar un formulario de seguimiento posterior.

Resumen

Las plantas son organismos fotoautótrofos, es decir, emplean la energía de la luz solar para sintetizar sus propias biomoléculas. Aparte de las moléculas que componen su estructura y que proporcionan energía, existen los conocidos como metabolitos secundarios. Son productos provenientes de diferentes vías metabólicas y que tienen funciones ecológicas importantes. Los seres humanos a lo largo de nuestra historia hemos sabido sacar provecho de estas sustancias al emplearlas con fines terapéuticos. Ejemplos son la morfina procedente de la adormidera blanca, los alcaloides de la vinca, la capsaicina de los pimientos y muchos otros. En la actualidad forman parte de nuestro arsenal farmacológico, pero existen todavía una inmensa cantidad de especies sin estudiar, por lo que nunca se sabe cuál podrá ser el siguiente fitoquímico revolucionario. En un recorrido por el Jardín Botánico de la Universidad de Alcalá, se pueden apreciar las características morfológicas, ecológicas, evolutivas, farmacológicas y moleculares de las plantas que ahí se encuentran. El Jardín cuenta con gran cantidad de plantas, tanto autóctonas, de diversos ecosistemas de nuestro país, como de otros lugares del mundo, algunas en invernadero. Además, podemos encontrar una huerta ecológica con plantas de interés medicinal y nutricional. Este recorrido permite transmitir a los visitantes una visión completa de lo interesante y útiles que son las plantas.

Materiales requeridos

• Fiji (ImageJ). Descargar e instalar programa.
  https://imagej.net/software/fiji/
• Imagen de prueba:
  imagen_prueba.zip
• Otros documentos y enlaces enviados por email a todos los participantes inscritos. Si no lo ha recibido, por favor, escriba al organizador del curso.

Introducción a la Mecanobiología: conversaciones entre física y biología.

Fidel Lolo Romero
Grupo de mecanoadaptación y biología caveolar
Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares, CNIC

21, 22 y 23 de marzo de 2023

Actividad Formativa multirrama para Salud, Ciencias e Ingenierías

El curso de “Introducción a la Mecanobiología: conversaciones entre física y biología” se realizará de forma presencial en el Edificio de Medicina y Ciencias de la Salud (aula por determinar) con retransmisión simultánea por videoconferencia usando la plataforma de la Universidad de Alcalá. El enlace a la sesión es el siguiente:

https://eu.bbcollab.com/guest/fb09ac207a7f4e89b867ca38d245349f

21, 22 y 23 de marzo

Por favor, utilice su nombre y apellidos para identificarse en la sesión de cara a poder realizar el seguimiento de asistencia y la certificación posterior.

Formulario de inscripción

El Curso de «Introducción a la Mecanobiología: conversaciones entre física y biología.» está organizado por el Programa de Doctorado en Señalización Celular. Está integrado en el VIII Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2023, y constituye una Actividad Formativa multirrama de la Escuela de Doctorado de la Universidad de Alcalá, ofertado para las ramas de Salud y Ciencias.

El Curso consta de cinco horas totales distribuidas en tres sesiones según se detalla más abajo, en el apartado de Calendario y objetivos de aprendizaje. Para el reconocimiento del curso como actividad formativa de doctorado será necesario, por normativa de la UAH, rellenar un formulario de seguimiento posterior a cada sesión.

Resumen

¿Puede un biólogo entenderse con un físico? Este curso-taller revisa distintas tecnologías que nos permiten ahondar en los misterios de la mecanobiología celular, la capacidad de las células para percibir y transducir estímulos mecánicos. El curso se divide en tres sesiones: una primera sesión de “introducción a la mecanobiología”, de una hora de exposición seguida de debate, y dos sesiones teórico-prácticas de dos horas cada una, dedicadas a “mecanobiología vascular” y “mecanobiología del sistema nervioso”. Cada una de estas dos sesiones incluye una hora de exposición seguida de una hora de actividad práctica guiada, con información y materiales experimentales reales, aplicando estrategias computacionales de extracción y análisis de datos.

Materiales requeridos

• Fiji (ImageJ). Descargar e instalar programa.
  https://imagej.net/software/fiji/
• Imagen de prueba:
  imagen_prueba.zip
• Otros documentos y enlaces enviados por email a todos los participantes inscritos. Si no lo ha recibido, por favor, escriba al organizador del curso.

Calendario y objetivos de aprendizaje

Sesión 01 – Introducción a la mecanobiología

21/03/2023 (15:30 – 16:45)

Sesión 02 – Aproximación a la mecanobiología vascular.

22/03/2023 (15:30 – 17:45)

• Mecanobiología como base de la patología vascular.
• Actividad práctica guiada. Se utilizarán resultados y materiales experimentales reales suministrados y aplicación de estrategias computacionales de extracción y análisis de datos.

Sesión 03 – Aproximación a la mecanobiología del sistema nervioso

23/03/2023 (15:30 – 17:45)

• Mecanobiología como base de la neuropatología:
  potenciales implicaciones.
• Actividad práctica guiada. Se utilizarán resultados y materiales experimentales reales suministrados y aplicación de estrategias computacionales de extracción y análisis de datos.

 

Introducción a los ensayos clínicos y opciones de desarrollo profesional en el sector.

Lorena Torres Valle

19 de marzo de 2024

Actividad Formativa multirrama para Salud y Ciencias

El curso de “Introducción a los ensayos clínicos y opciones de desarrollo profesional en el sector” se realizará de forma presencial en el Edificio de Medicina y Ciencias de la Salud (aula por determinar) con retransmisión simultánea por videoconferencia usando la plataforma de la Universidad de Alcalá. El enlace a la sesión es el siguiente:

https://eu.bbcollab.com/guest/3fb8f63ab6904e9b845f01ee5585ff9b

jueves, día 23 de marzo, de 17:00 a 19:00 horas

Por favor, utilice su nombre y apellidos para identificarse en la sesión de cara a poder realizar el seguimiento de asistencia y la certificación posterior.

Formulario de inscripción

El Curso de «Introducción a los ensayos clínicos y opciones de desarrollo profesional en el sector.» está organizado por el Programa de Doctorado en Señalización Celular. Está integrado en el VIII Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2023, y constituye una Actividad Formativa multirrama de la Escuela de Doctorado de la Universidad de Alcalá, ofertado para las ramas de Salud y Ciencias.

El Curso consta de una sesión de una hora de exposición seguida de debate. Para el reconocimiento del curso como actividad formativa de doctorado será necesario, por normativa de la UAH, rellenar un formulario de seguimiento posterior.

Resumen

La actividad consistirá en una introducción al desarrollo de los ensayos clínicos en España para conocer a los diferentes actores y escenarios que existen bajo la legislación actual, con la finalidad de poner en contexto y entender las posibilidades laborales y de desarrollo en el sector.

Aprendizaje profundo aplicado en biomedicina.
Detección de cánceres de piel.

Raúl Fernández Díaz

14 a 16 de marzo de 2022

Actividad Formativa multirrama para Salud, Ciencias e Ingenierías

El taller de aprendizaje profundo en biomedicina se imparte de forma remota por videoconferencia en la plataforma de la Universidad de Alcalá. El enlace a la sesión, igual para los tres días del taller, es el siguiente:

https://eu.bbcollab.com/guest/c4d7de338b6e4dc7b73dd5d5dfcb1514

Por favor, utilice su nombre y apellidos para identificarse en la sesión de cara a poder realizar el seguimiento de asistencia y la certificación posterior.

Formulario de inscripción

El Curso de «Aprendizaje profundo aplicado en biomedicina. Detección de cánceres de piel.» está organizado por el Programa de Doctorado en Señalización Celular. Está integrado en el VII Congreso de Señalización Celular, SECUAH 2022, y constituye una Actividad Formativa multirrama de la Escuela de Doctorado de la Universidad de Alcalá, ofertado para las ramas de Salud y Ciencias.

El Curso consta de tres sesiones de una hora de exposición seguida de debate cada una. Para el reconocimiento del curso como actividad formativa de doctorado será necesario, por normativa de la UAH, rellenar un formulario de seguimiento posterior a cada sesión. El enlace se publica en el transcurso de la sesión.

Resumen

Las técnicas de aprendizaje profundo (deep learning) están adquiriendo creciente importancia en todos los campos de la ciencia, pero tienen un enorme potencial especialmente en biomedicina para facilitar el diagnóstico de enfermedades o acelerar el descubrimiento de medicamentos. En este taller se realizará una exposición de qué son las redes neurales, cómo funcionan y qué aplicaciones tienen. Recorreremos las principales arquitecturas avanzadas: redes recurrentes (RNN) y redes convolucionales (CNN), haciendo especial énfasis en las segundas. Los conceptos teóricos se ilustrarán con una serie de simuladores a lo largo de las 2 primeras sesiones y se cristalizarán en la tercera sesión con un caso práctico que consistirá en la clasificación de fotografías de lesiones en la piel como cancerosas o benignas. Los participantes tendrán la oportunidad de recorrer paso por paso el código necesario para poder diseñar, entrenar y validar una DCNN y cada uno podrá customizar la arquitectura para tratar de obtener el mejor modelo posible.

Materiales requeridos

• Cuenta de Google Drive.
• Dos archivos que se proveerán por correo electrónico tras la inscripción en el taller. También puede descargar aquí el archivo comprimido en zip: taller_aprendizaje_profundo_archivos

Calendario y objetivos de aprendizaje

Sesión 01 – Fundamentos de aprendizaje profundo

14/03/2022 (15:30 – 16:45)

• ¿Qué es el aprendizaje atomático?
• ¿Cómo funcionan las redes neurales?
• ¿Qué problemas podemos encontrar al utilizarlas?

Sesión 02 – Aplicación de arquitecturas avanzadas en biomedicina

15/03/2022 (15:30 – 16:45)

• ¿Por qué usar arquitecturas avanzadas?
• ¿Qué son las redes recurrentes (RNN)?
• ¿Qué son las redes convolucionales (CNN)?
• Aplicaciones en biomedicina: RNN para la creación de bibliotecas de moléculas candidatas contra dianas específicas y CNN para predicción de sitios de unión a ligandos en proteínas

Sesión 03 – Introducción a programación de redes neurales convolucionales

16/03/2022 (15:30 – 16:45)

• Práctica: Introducción a libretas de Google Colaboratory
• Práctica: Introducción al dataset
• Práctica: Preparación de los datos
• Práctica: Diseño y entrenamiento de la red neural
• Práctica: Interpretación de los resultados y validación del modelo